回到保安处不久，蒋经国又有了新的任务。1938年9月，熊式辉以江西省政府的名义发表公告，任命蒋经国为江西省保安司令部新兵督练处处长。
新兵督练处设在临川温泉，主要集中训练江西省新征来的壮丁，实际上是为野战部队训练补充团。这是蒋经国回国后初露头角、第一次独当一面的职务，自然希望一显身手，有所作为。很快，蒋经国就着手制定了练兵计划。他胃口很大，决定第一批要训练六个团。虽说他是列宁格勒军政学校毕业的，但他没有亲自带过兵。国民党的兵多半是抓来的，刚从农村抓来的壮丁甚至连做梦都开小差，一跑就是一大串，几十个甚至几百个。因此，新兵进营没几天，便逃走了五六百人。
逃兵问题令蒋经国大为恼火，不知如何办。他找到训练处政治组副组长徐君虎商讨对策，徐为蒋经国在莫斯科留学时的同学。
徐君虎对蒋经国说：“你得先多设置几个牢头禁子才行。”
蒋经国不解地看着他。
“新兵营营房里，成百壮丁关在一间房内，屎尿拉得满地都是，比看守犯人还严，哪能不逃跑？”
蒋经国说：“你给想个根治的办法。”
徐君虎早有构想，当即掏出写满字的纸给他，说：“这八条措施，你能不能采纳？”
蒋经国认真地看起来。这八条措施是：
一、将营房周围村子全部划归新兵训练处，给予新兵大范围内活动自由，以解除其精神压力；
二、禁止体罚新兵；
三、参照苏俄军营设立列宁室的办法，新兵营设中正室，开展读书、玩牌、打球等娱乐活动；
四、改善新兵生活，设置生活车，放电影、发慰劳品；
五、实行新兵家属优抚条例（服役期间，每年给士兵家属发放谷物钱钞，佃主对在役兵员租佃的田土不得解雇改佃）；
六、成立优属委员会，允许军属来营房探亲；
七、向新兵原籍之县、乡、保、甲送达优抚条例，并检查其执行情况，条例上大书“蒋经国敬托”五个大红字；
八、枪决罪大恶极之兵贩子以儆效尤。
蒋经国看后大喜，立即同意执行。当即委任徐君虎为“优待军属委员会”总干事，要求徐君虎认真实施这八条措施。很快，逃兵现象减少了。
蒋经国认为光有这些措施还不能让新兵安心受训，得从思想上教育士兵，让士兵有爱国爱家乡的感情，自愿保家卫国。为此，他想到了在苏联军校和野营训练时的情形，他高兴地对徐君虎说：“我们还要加强士兵的思想政治教育，即在加强军事训练的同时，要深入地对士兵进行保家卫国的教育，启发他们的民族意识，说明国难当头，保家卫国是军人的神圣职责，把国家的安危和他们的家庭利益紧紧地联系起来。”
对于军官教育，他则反复宣传王阳明学说。他还遵从蒋介石的教诲，把《增补曾胡治兵语录》、戚继光《纪效新书（练兵实记）》等列为军官必读书籍。他还经常对军官说：“我们要关心士兵们的物质、文化生活。官长要去掉军阀作风，不许随便打骂士兵。”
蒋经国又对一些“专以卖身给有钱人家顶替壮丁来赚钱的兵痞”进行惩处。这些兵痞十分可恶，他们卖一次得一笔钱，到了部队就跑，跑出来吃喝嫖赌干坏事，钱花光了再卖，有的已经卖过三次了。他对这样的“兵痞”执法如山，严惩不贷！
新官新作风，蒋经国率先垂范，树立榜样。他把苏联的官兵关系搬过来，运用自如。他自己本来也没有架子，平易近人，和士兵们生活在一起，同住宿，如同家人。许多青年军官更是佩服得五体投地。赣南11县的驻军团长，过去常拥兵自重，不把省政府和专署放在眼里。省里委任县长需他们首肯，方能上任。省里的军事会议他们都拒不参加。可是，有一次熊式辉却见蒋经国带着好几名团长去省府玩，谈笑风生，异常亲热。熊式辉见状大吃一惊：这些骄横的家伙连我都不买账，为什么会跟着蒋公子转？他派人打听，这些团长们说：“士为知己者死，俺这一腔热血就卖给识货的。蒋处长把我们兄弟当人看，我们自然拥戴他。”后来，国民党要将温泉四个团调往前线，官兵们不肯出发，通电非要蒋经国当军长他们才肯去，经徐君虎出面协调才解了这个结。
训练新兵的成功，使蒋经国出了名。李宗仁想组织学生军，建议蒋介石任命蒋经国当军长；苏联援助中国抗日预备赠送一批新式兵器，何应钦想用这批兵器成立机械化师，就向蒋介石推荐蒋经国当师长。尽管他们的建议被蒋介石拒绝了，但蒋介石对儿子初涉政界、军界即崭露头角十分得意，曾指示国民党一些部队派人到江西新兵督练处参观。后来，蒋经国把这一段督练新兵的过程，编了一本《温泉练兵实纪》。临川温泉练兵，是蒋经国事业的开端，为他以后在政治、军事上的发展开了一个好头。
