年轻的顺帝即位后，朝中出现燕铁木儿家族势力与伯颜相对峙的局面。为了平衡朝中各派势力，元统元年六月，顺帝在谋臣的建言下任命伯颜为太师、中书右丞相、上柱国、监修国史，兼奎章阁大学士，领学士院、太史院、回回、汉人司天监事，燕铁木儿的弟弟撒敦为太傅、左丞相。顺帝的这一任命明显带有削弱燕铁木儿家族的意图，而伯颜在拥立顺帝的问题上表示了支持的态度。但长期专权的燕铁木儿家族在朝中党羽遍布，势力巨大，顺帝也不得不对其加以安抚、重用，否则很可能再次出现宫廷政变。元统元年八月，顺帝又立燕铁木儿的女儿伯牙吾氏为皇后。十月，封撒敦为荣王，食邑庐州；撒敦的弟弟知枢密院事答剌罕答里进阶金紫光禄大夫；燕铁木儿之子唐其势则袭父封为太平王，也进阶金紫光禄大夫。元统二年（1334）四月，顺帝命唐其势为总管高丽女直汉军万户府达鲁花赤，与伯颜的弟弟马札儿台并为御史大夫，同时诏加荣王左丞相撒敦为开府仪同三司、上柱国、录军国重事，食邑庐州。
与此同时，右丞相伯颜势力增长，已经超过了燕铁木儿家族。元统二年，顺帝进伯颜为太师、奎章阁大学士，领太史院，兼领司天监，威武、阿速诸卫；奏复经筵，加知经筵事。十一月，伯颜进封秦王，继领太禧宗禋院、中政院、宣政院、隆祥使司、宫相诸内府，总领蒙古、钦察、斡罗思诸卫亲军都指挥使。伯颜势力的增长，必然使其与以前具有支配地位的燕铁木儿家族发生矛盾和冲突。不久，中书左丞相撒敦去世，燕铁木儿家族的势力进一步削弱，虽然顺帝随后任命唐其势为中书左丞相，但其已经很难左右朝政了。唐其势十分恼怒地说道：“天下本我家天下也，伯颜何人，而位居吾上！”唐其势便与撒敦的弟弟答里阴谋政变，他们联合诸王晃火帖木儿，谋划废黜顺帝。不料，郯王彻彻秃得知唐其势等人的阴谋后，将此事通告了顺帝。
后至元元年（1335）六月三十日，唐其势在上都东郊埋伏好士兵，自己亲率勇士冲入宫阙。由于顺帝早有准备，伯颜及岐阳王完者帖木儿、中书平章政事定住、知枢密院事阔里吉思等，将唐其势等拿获，随后唐其势及其弟塔剌海皆被杀。唐其势的党羽闻讯后向北逃窜到撒敦的弟弟答里之处，答里随即举兵叛乱，并杀害朝廷使者哈儿哈伦、阿鲁灰。顺帝又遣使节阿弼前往招降答里，答里又将阿弼杀害。于是答里率党羽和尚、剌剌等与朝廷的军队作战，结果兵败，逃奔诸王晃火帖木儿。顺帝便命大臣孛罗、晃火儿不花追袭答里，答里穷途末路，被朝臣阿鲁浑察执送上都，顺帝随即下令将答里诛杀。而诸王晃火帖木儿受到牵连，被迫自杀。怯薛官阿察赤也因参与了唐其势之谋而被杀。
当初唐其势事败被擒之后，攀折皇宫大殿门槛不肯出，结果被强行拖出诛杀。唐其势的弟弟塔剌海逃到伯牙吾氏皇后座位之下，皇后用衣服将塔剌海遮蔽起来。伯牙吾氏皇后左右之人发现后，将塔剌海拖出斩杀，血溅皇后之衣。权臣伯颜为此上奏，请求治伯牙吾氏皇后同谋之罪，顺帝便命人将伯牙吾氏皇后拿下。伯牙吾氏皇后大呼：“陛下救我！”顺帝说道：“汝兄弟为逆，岂能相救邪！”于是驱逐伯牙吾氏皇后出宫，不久在大都附近的开平民舍将其鸩杀。顺帝还下令籍没唐其势一家的家产。之后，伯颜还对燕铁木儿委任的亲信进行了清洗。后至元元年七月，朝廷罢燕铁木儿、唐其势举用之人，诛杀答里及剌剌等于市，并诏告天下，一说明燕铁木儿阻碍顺帝即位以及撒敦、答里、唐其势等阴谋政变的罪行，一赞誉和奖赏丞相伯颜的拥戴及其铲除燕铁木儿势力之功。同年十月，顺帝流放晃火帖木儿、答里、唐其势的子孙于边远之地。
伯颜在协助顺帝铲除燕铁木儿势力的同时，又重蹈燕铁木儿专权的覆辙。后至元元年七月壬辰，朝廷加拜伯颜的弟弟马札儿台为银青荣禄大夫、开府仪同三司，领承徽寺；壬寅，专命伯颜为中书右丞相，罢左丞相不置。伯颜自诛唐其势之后，独揽朝政，专权自恣，变乱祖宗成宪，虐害天下，渐有奸谋。自从统领诸卫精兵后，伯颜以燕者不花为屏蔽，其宿卫随从众多，填溢街衢。而顺帝身旁的宿卫则落落如晨星，十分稀少。伯颜势焰薰灼，天下之人惟知有伯颜而已，而原来在朝中有一定势力的文宗皇后，这时也仅享有着太皇太后的荣誉头衔。（《元史》卷三十八《顺帝本纪一》；《元史》卷一百三十八《伯颜传》、《燕铁木儿传》）
伯颜当政时期，擅自封授官爵，赦免死罪，任用邪佞之人，杀害无辜，将诸卫精兵收为己用，国家府库钱帛听其出纳，时人称“天下贡赋多入伯颜家”。由于伯颜擅权专权，以及吏治腐败、财政入不敷出、赋税不均等等弊政积重难返，这一时期的元代社会动荡不安，民众的反抗斗争此起彼伏。为了能够制止汉人、南人的反抗，伯颜推行更为严厉的民族控制政策。元廷下令汉人、南人、高丽人不得执持军器，凡有马者拘收入官，同时省、院、台、部、宣慰司、廉访司及部府幕官之长，并用蒙古、色目人，汉人、南人不得学习蒙古、色目文字。伯颜甚至主张诛杀张、王、刘、李、赵五姓汉人，当然这一过激的民族屠杀政策并没有得到顺帝的同意。（《元史》卷三十八、三十九《顺帝本纪》；《庚申外史》；《元史》卷一百三十八《脱脱传》）
在伯颜实行的各种弊政中，一项非常重要的政策是废除科举制。其实，元代科举制自仁宗朝正式推行以来，不断有人企图废罢之。后至元元年十一月，在伯颜的极力主张下，顺帝下诏废罢科举。力主废罢科举的元廷官员除伯颜外，最为积极的当数中书平章政事彻里帖木儿。后至元元年，御史中丞彻里帖木儿进入中书省后，以罢科举为第一事。在伯颜的积极支持下，彻里帖木儿废罢科举的动议得到了顺帝的批准。据载，当时废罢科举的诏书已经写好，只是还没有加盖玉玺，中书省参政许有壬就此事与伯颜、彻里帖木儿据理力争，当时掌权的伯颜根本不把许有壬放在眼里，反对其嘲笑、讥讽。待到废科举诏书在崇天门宣布之时，伯颜等特令许有壬为朝堂班首以折辱之。至于伯颜废罢科举，既有他个人对科举制的憎恶，又有借废止科举打击儒臣的政治目的。当时以御史台为中心的儒臣集团，已成为伯颜垄断朝政的一大障碍。反对废罢科举制的中书参政许有壬，曾对太师、右丞相伯颜说道：“御史三十人不畏太师而听有壬。”（《元史》卷三十九《顺帝本纪二》；《元史》卷一百四十二《彻里帖木儿传》；姚大力《元代科举制度的行废及其社会背景》）
