1311年，武宗的弟弟爱育黎拔力八达以皇太子身份主政，立即废除了尚书省，捕杀了脱虎脱等人，在同年1月18日即位，是为仁宗。
仁宗在位的时候国内局势相对稳定。他虽然对蒙汉之间的隔阂仍未消除，但他却注意任用汉人中的南人，他在位期间，中书省先后担当过中书平章政事和其他要职的汉人就有15位之多。他实行废弃多年的科举制度，命人用蒙文翻译了《孝经》、《烈女传》、《大学衍义》和《贞观政要》等书。可以说，仁宗是继忽必烈后，元朝十位皇帝中唯一的一位贤主。
仁宗统治前期推行汉法。首先他力图抑制诸王贵戚们的权利，以加强皇权。其次，仁宗想用儒术澄清吏治，强化政治的运作程序。
1313年4月，仁宗废除了诸王封地。为防止镇北亲王们拥兵夺权，仁宗命驸马丑汉出总北军，加封为安远王，并加强了居庸关的军事守备。为澄清吏治，仁宗严禁近侍干政，整顿选法，重用儒士。1314年，元朝举行了实行科举制度后的第一次乡试。考试仍以对程朱理学、儒学等经典阐释为判卷标准，用来推动理学的传播普及。这一次科举考试的意义很大，自从13世纪30年代元朝灭金，科举取士制度在中原汉地停废了近一个世纪，仁宗复科，对当时的整个社会都产生震动性的效果，给汉族儒士带来了很大的希望。尤其是处于压抑状态中的士人，更把它看作是“文运将兴”的标志。不过元朝科举取士的规模相当有限，对于真正改变当时的政治构成并没有太大的作用。
李孟是仁宗统治时期的名臣。他是山西人，曾做过武宗和仁宗的老师，并且还扩充了“国子学”的教学内容，教出了不少蒙古子弟与汉人、南人子弟。成宗时李孟做过礼部侍郎，后来跟随仁宗住在今河南沁阳。成宗去世后，他随仁宗入京，在武宗海山的夺权过程中起到了一定作用。武宗时李孟因对时政不满，就在河南许昌隐居了数年。直到1310年才被召回，武宗死后，李孟被仁宗重用，先后任中书平章政事和议事平章及翰林学士承旨。
李孟可说是一位一心为民、一心为政的好官。他最主要的功绩是废除了元朝一直实行的“病民之政”和劝说仁宗恢复了科举制度。1311年，在元朝的第一次科举考试中，他被仁宗任命为主考官。录取了护都沓儿为蒙古色目榜的状元，张起岩为汉人南人榜的状元。
仁宗的统治可说是对武宗时期的一个纠正。但可惜因为仁宗性格稳重，缺少主见，始终摆脱不了权臣的迷惑，使他的统治后期出现了奸臣铁木迭儿。
仁宗不好色，信佛，也不喜欢发动战争，对各种宗教能采取宽容政策，并且生活节俭，不兴盖宫殿庙宇。只是，他和窝阔台一样，是一个喜好酒的男人，最后也死在了酒上，只活了三十六个春秋。
