随着对宋战争的展开，刚有起色的财政又陷入了困境，阿合马不得不想新招来应付眼前的饥荒，以求继续得到忽必烈的宠信，他想到两招，其一滥发纸币，二增加税收。忽必烈时发行的纸钞叫做中统元定交钞，简称宝钞。它以银为本，每两贯钞折银一两，开始发行时信誉很好，可以随时持往官库存兑换银两，币值也很稳定，民间很看重宝钞，甚至于视钞甚于重银。阿合马也重视宝钞，因为他已经从宝钞当中看到滚滚而来的财源。阿合马随心所欲地增加宝钞的发行量。从原来每年的十万锭增加到数十乃至最高达到一百九十余万。
与此同时，他又把各地库中的钞本金银悄悄运回了京城，借皇定官府挥霍，一时间，宝钞一下子变成了一文不值的废纸，造成了物价飞涨，一石宝钞竟然换不了一斗小米，百姓们无不怨声载道，每有一个不憎恨阿合马的，简直是憎恨到了极点。他的第二个增加收入的方法就是增加赋税，这是封建政府敛财的一个常用手段，只不过在阿合马手中玩出了新花样。粮、盐茶等税不说，他还增加了醋税，甚至老百姓的家里死了人，也要交一笔莫名其妙的丧葬税，至于其他阿合马下令增加的税种更是多如牛毛，数也数不过来。经过阿合马一番的调整，元朝的财政又有了较大的恢复，由此，忽必烈更加的寄信阿合马，把他视为自己最大的功臣，对阿合马也宽容到了极点，只要没有冒犯自己的尊严，阿合马无论做了什么坏事，他是从来都不过问的，实在有些看不过眼的，也就只是打打板子也就是了，但阿合马的平章政事一职，却从来没有给他动过。
由于忽必烈给他的实在是太多了，他希望别人也给予他更多的东西，例如尊重啥的，讨好他。然而事情并没有像他想像的那样好，有许我的人都视他为跳梁小丑，对他的讥讽从来都没有断过。阿合马自感羞愧之外，也对这些人是恨之入骨，他想想尽一切办法来打击异己。阿合马首先要打击和排挤的是中书右丞相安童。安童系名门出身，在十三岁的时候做了怯薛首领，成为了最显赫的四怯薛长之一。在十八岁的时候，他被任命为中书右丞相，他在汉人老师许衡的影响下，成为朝中汉法派代表，经常将些汉儒引入中书省，这些都极大的惹恼了阿合马，他要绕开安童。
于是他请求在中书省外设尚书省成为理财的最高机构，忽必烈又是一如既往的同意了他的请求，并任阿合马为平章事尚书省事。从那个时候起阿合马就逐渐与安童相抗衡了。他一心想排挤走安童，但是他又知道安童并不是一个普通人，只好利用暗地架空的方法，在1268年，阿合马上奏忽必烈，请求以安童为三公，说安童这样的名臣如果不位列三公的话，实在是于理不合。然而别看他说的好听，但实际上三公乃是荣誉头衔，根本就没有任何的实权，由于汉人官员的极力反对，所以阿合马的诡计才没有得逞。后来由于忽必烈最后还是听从了阿合马的谗言，让安童随北平王南木出镇和林，阿合马终于如愿以偿的将安童排挤出朝廷，之后阿合马在朝中更是为所欲为了。
前面还说过有一位畏吾儿的官员叫廉希宪，他接受了汉族的文化，在忽必烈实现他的雄心壮志和抱负过程当中，给了他很大的帮助，后来任中书右丞和平章政事，但是他的政见肯定与阿合马不同，并且由于廉希宪刚正不阿，在一次阿氏集团之间的内讧当中，让一贯骄横的阿合马挨了几十大板，使他成了阿合马恨不得食其肉，饮其血的不共戴天之仇人。阿合马一直就想寻找机会来除掉廉希宪。可是哪里有那么容易，廉希宪又不是他阿合马贪赃枉法，无法无天，为官十分的清廉，又深得忽必烈的信任，一时间根本就找不到什么借口，只有把仇恨深深的埋在了心里。可是时机终于来了，时间终于过了这么几年，廉希宪由于当面顶撞了忽必烈，被忽必烈一怒之下罢了他的官职。当时阿合马是欣喜万分，可是好景不长，没有多长的时间，忽必烈因为知道廉希宪乃是一个大大的忠臣，就又想让廉希宪出任宰相，可是这时候阿合马怎么可能再让廉希宪上台呢？所以是极力编造一大串的理由，终于说服了忽必烈让廉希宪行省荆南，使得廉希宪远离了京城。
自此以后，廉希宪是再也没有机会掌握实权了。阿合马在至元十年，请求忽必烈让其子忽辛担任一个军事要职，可是被许衡极力反对，许衡说道：“国家大事，无非兵、民、财而已。如今阿合马已经掌握了民权与财权，又让儿子领兵，这可是万万不行的。”忽必烈有些奇怪的问道：“难道你认为阿合马会造反吗？”许衡说道：“那臣不敢断言，不过即使他不会造反，那他也具备了造反的条件了！”忽必烈就是因为这个原因没有同意阿合马的要求，而阿合马由此大恨许衡，时不时的与许衡过不去，甚至陷害污陷。他还曾经公报私仇的下令停止了供应许衡所持的国子学粮食，使得许衡粮绝炊断，诸生是接连而去，许衡被逼无奈之下只得辞职而去。更为疯狂的是，阿合马还诬杀了曾在朝廷当着皇帝的面指斥他的崔斌，以及上书参他一本的秦长卿，而且其手段是十分的毒辣。阿合马不只是在朝里如此胆大妄为，而且在外面也是十分的骄横，他一听说谁家有漂亮的女儿，就派人到她父亲的那里，对人家说道：“听说你有一个漂亮的女儿，那就嫁给我们的阿合马大人吧！他能叫你当上三年的封疆大吏，或者是其它的高官，怎么样？同意吗？”
