外祀
明万历元年秋七月，漳泉贼犯福宁州，把总刘国宾战死。
贼屠塘头堡，航海犯松山，官兵拒战，败绩。
冬，广东海寇林凤犯福建，总兵胡守仁击走之。
时寇盗略尽，惟凤遁钱澳求抚，广督云翼不许，遂自澎湖奔东番魍港，为胡守仁所败，追至淡水洋沈其舟，凤复入潮州。
八月（年），倭犯澎湖东澳。
十年，浦城贼流劫福宁州。
十一年夏四月，龙溪县民吴双引等谋作乱，伏诛。
双引等谋袭郡城，会久雨，城东南隅圯数丈，双引以为天助，乃积刍府前涂嵩家，约其党潘国佐等装器械南河舟中，约举火为号。贼有黄疆者，素德于谢氏，私语其故。谢固要疆首于指挥甘氏，私密遣卒环嵩家前后伺守。署府推官丁此吕、督捕同知沈锐搜获引等八人。国佐等见城上不举火，知事泄，各逸去。次日，悉捕获之。余党日布讹言，城中惶惧。巡海道徐秋鹗廉获首孽，置诸法，讹言始息。
十四年，倭谋寇福建不果。
倭将大举入寇，虑琉球泄其谋，令毋入贡。时同安人陈甲行商琉球归，上其事于巡抚赵彦鲁。倭闻有备，乃寝。
十六年冬十二月，莆田县民柯守岳等作乱。
守岳，邑广业里下溪人。妄言惑众，扮鬼面，大耳长髯，垂帘受揖。免洋奸民曾廷邦及畬民雷五等附和之。宣言海上游天王有神异兵机，欲图天下。从者鼎沸。守岳立赤帜，以书生陈文章为参谋。是月二十三日自涂靡坑拥至枫岭亭，燃炳集齐。及乌山炮声三不起，众骇散，存者不过五六十人，守岳等遂逃回涂靡坑，招纳凶徒期再举。畬民囊豚毛走报百户高泰、王元阳。泰、元阳亟诣分守冯孜告变。孜遣把总期全领兵百余哨探，全不敢进。
十七年三月，巡抚周寀遣兵平之。
是年正月十五日，守岳等率众直趋院埔竖帜，大书「游天王镇江山救万民」九字，遂剽掠永福县之五都。寀遣把总王子龙督兵循永福抵贼营。三月朔日，战于大洋，斩贼酋邱汝夫等，余党奔散。胡全与哨官何维德、陈文正分路追捕，获雷五等十余人。初三日，贼复聚。乡勇黄子敏突战死。知县孙继有募兵平之。守岳及其党皆就擒，伏诛。
十八年夏四月，漳州府饥民作乱，知府李载阳捕平之。
二十年春二月，长泰县民蔡扬中等作乱，伏诛。
扬中等修斋聚徒，谋乘夜袭县城。邻人蔡炳密白其事于知县李学诗，捕扬中等，一鞫尽服。适延平推官罗心尧以行部至长泰，再讯，具得其实，同谋者满纸。心尧密谕学诗捕素无赖数人，与扬中等俱解府。郡守李载阳谓反形未具，宜释之。学诗泣争乃返。诸贼系之狱。余党约三月朔日夜举事，贼党误听，于二月晦日夕诸贼戕狱卒突入县衙，学诗身被数刃。贼以为令毙，纵火登城杀守卒，喊声震地。应者以非期不至。贼斩北关出。日午，为乡兵所擒。
二十二年夏五月，福州府饥民作乱。
福州连岁不登，阖城米肆尽闭。东门李章家故饶，仓多陈腐，故昂其价，令籴者鳞次而入，有自辰至午不得入，乃大哗，众拥入，尽掠其米。放火焚仓，烈焰亘天。巡抚许孚远闻变，遣营将古应科提兵捕之。凶首逸去。是夜奸民邓三鼓众焚古应科居屋，为营卒所擒。城内外闻风抢掠者十余处。孚远遣兵分布城中，固守各巷口栅门，戒人夜出。次日，大发仓廪，乱遂定。后巡抚金学曾至，斩邓三等于市。
二十五年，海贼无齿老寇漳浦县古雷澳，把总张万纪歼之。
二十九年，倭犯福宁嵛山。
倭突至嵛山杀守澳哨官，进泊松山三日，福宁戒严。次日浙人毛国科偕倭奴来驾，言赍日本国王檄求贡市。州牧宴国科及倭奴于松山，竟脱去。
是年，泉州都司佥书沈有容击倭于澎湖，大破之。
先是，日本封事坏，巡抚金学曾欲用奇捣其穴，起有容守浯屿、铜山。是年，倭掠诸寨，有容击败之。踰月，与铜山把总张万纪败倭彭山洋。倭据东番。有容守石湖，谋尽歼之。舟过澎湖，与倭遇，格杀数十人，纵火沈其六舟。倭遂去东番。海上息肩者十年。
三十一年，吕宋杀福建人在其国者二万五千人。
先是，闽中以吕宋地近且饶富，商贩者至数万人，往往久居不返，至长子孙。佛郎机既夺吕宋国，遣一酋来镇会督矿税太监高寀至闽。奸宄蜂起献利。有阎应龙、张嶷者，言吕宋机易山素产金银，采之岁可得金十万两、银三十万两。以三十年七月奏闻，神宗纳之，举朝骇异。都御史温纯疏谏，言『中外诸臣，争陈矿税之害，天听弥高。今闽中奸徒又以机易山事见告，臣闻海澄市舶高寀岁征三万金，已不遗余力而攘利。机易越在海外，决无遍地金银任人采取之理，不过假借朝命，阑出禁物勾引诸番，以逞不轨之谋。岂止烦扰公私、贻害海澄一邑而已哉。昔年倭患，正缘奸民下海私通，大姓设计勒价，致倭贼愤恨，称兵犯顺。今以朝命行之，害当弥大。及乎兵连祸结，诸奸且效汪直、曾一本辈故智，负海称王，拥兵列寨，近可以规重利，远不失为尉陀。于诸亡命之计得矣，如国家大患何』？不听。事下福建，乃遣海澄丞王时和、百户千一成偕嶷往勘。吕宋人闻之大异。及时和等至，酋设宴问曰：『天朝欲遣人开山，山各有主，安得开？譬中华有山，可容我国开耶？且言树生金豆，是何树所生』？时和不能对，还任即病悸死。守臣以闻，请治嶷妄言罪。事已止矣，而吕宋人疑天朝将袭取其国，诸流寓者为内应，潜谋杀之。声言发兵侵旁国，厚价市铁器。闽人贪利，尽鬻之。于是家无寸铁，酋乃下令录闽人姓名，三百人为一院，入即歼之。先后死者二万五千人。酋出令，诸所掠货悉封识贮库。移书闽中守臣，言华人将谋乱，不得已先之，请令死者家属往取其孥与帑。巡抚徐学聚告变于朝，神宗惊悼，下法司议奸徒罪。议上，神宗曰：『嶷等欺诳朝廷，生衅海外，致二万商民尽膏锋刃，损威辱国，死有余辜，即枭首传示海上。吕宋酋擅杀商民，抚按官议罪以闻』。学聚等乃移檄吕宋，数以擅杀罪，令送死者妻子归。竟不能讨。
三十二年春三月，邵武盟香贼作乱，寻平之。
瓯宁县民吴建作乱，伏诛。
建，邑谢屯人。持古佛号煽党千余，渐事剽掠，一郡戒严。寿宁知县霍腾蛟时摄瓯宁，单骑往晓之。而都督府亦遣赍牌传谕。不解。于是兵备道刘毅檄，乡民得便宜擒剿，仍发兵屯大历口。官兵未至，乡民先捣其穴，建自杀，余党惊惧亦自杀。
秋七月，和兰犯澎湖屿，据之，寻引去。
和兰即红毛番也。先未尝入中国。自佛郎机市香山，和兰闻而慕之。其酋麻韦郎驾二大舰直抵澎湖。时汛兵已撤，如入无人之墟，遂伐木筑舍，为久居计。税使高寀遣心社周之范诣麻韦郎，说以三万金来馈，即许贡市。麻韦郎与之盟，已就矣。会总兵施德政令都司沈有容将兵往谕。有容负胆智，指陈利害。麻韦郎心折，乃曰：『我从不闻此言』。其下人露刃相诘。有容无所慑，盛气与辩。麻韦郎悔悟。而抚按严禁奸民下海，犯者必诛。由是接济路穷，番人无所得食。十月末，遂扬帆去。
是年，海贼周四老作乱，诏安知县黎天祚擒其二魁，斩之，贼遁去。
三十四年，漳浦庠生赵秉鉴谋袭县，知县黄应举捕擒之。
四十四年，倭犯福建。参将沈有容击败之。
有容先为温处参将，罢归。至倭犯闽境，巡抚黄承元请特设水师参将，起有容统之。有容擒倭东沙，招降巨寇袁进、李忠，散遣其众。
四十六年，海贼袁八老寇诏安县沿海村落，既而就抚。
天启三年，和兰复据澎湖屿。
先是，佛朗机横海上，和兰与之争雄，汛舟攻破美洛居国，与佛郎机分地而守，出泊澎湖筑城，渐为求市计。守臣惧祸，说以毁城远徙，即许互市。和兰从之。已而互市不成。和兰怨，复筑城澎湖，寻犯厦门。官军御之，俘斩数十人。乃诡词求款，而修筑如故。又泊舟风柜，出没浯屿、甲洲间，要求互市，招海寇李旦等为助，滨海郡县戒严。
四年春，福建巡抚南居益遣兵攻澎湖屿，和兰败走，获其渠帅高文律等。
巡抚商周祚罢，以南居益代之。居益初至，谋讨和兰，因列上调兵足饷方略，部议从之。是年正月，遣将先夺镇港筑城。和兰悉众争。官兵且筑且战。和兰退守风柜。相持数月，泛舟去。独渠帅高文津等十二人据高楼自守。诸将破擒之，献俘于朝。澎湖之警以息。
厦五月甲寅朔，福宁州变，有司抚定之。
是年，诏安乌山贼麦有章、金目寇县城，百户易弥光讨平之。
官军密令附山居民为乡导，侦贼粮尽复出，设伏扼其归路。弥光冒险深入，乡勇翼以长戟劲弩，遂荡其巢。
海寇颜思齐等入台湾，据之。
思齐，海澄人，为势家所凌，殴其仆致毙，虑罪逃入日本。久之，积蓄颇饶。晋江杨天生、莆田洪升、南安张宏、同安林福、南靖李俊臣、海澄陈衷纪等皆贾贩在日本，与思齐善。思齐见日本兵防怠弛，集诸人谋作乱。事泄航海奔入台湾。诸番散居，无君长。初悉居海滨。自嘉靖未遭倭焚掠，稍避居山后。至是，思齐率众据其地，勾引亡命，时出劫掠，为闽浙患。
六年春三月，海寇郑芝龙犯漳浦县。
芝龙，南安县石井人。少落魄，与弟芝虎、芝豹游广东。其母舅黄程行贾香山澳，遇芝龙，留之。已而为程贩货至日本，遂与颜思齐等相习。思齐之逃入台湾也，芝龙兄弟与之偕。及思齐死，众无所归，乃推芝龙为魁。三月，芝龙连〈舟宗〉浮海，自龙井登岸，袭漳浦镇，杀守将，进泊金门、厦门，竖旗招兵。饥民及游手悉往投之，旬日间众至数千。所在勒富民助饷，谓之「报水」，惟不许掳妇女、焚房屋，颇与他贼异。
夏四月，郑芝龙犯海澄县。
初，都督俞咨皋请于巡抚朱钦相，招抚海寇杨禄、杨策。禄、策既降，芝龙亦欲返正，托禄、策以达咨皋。禄、策要芝龙，不为通。芝龙怒，遣贼将曾五老泊海澄，寻大掠芦坑、溪尾、九都诸处，海澄村落无幸免者。
秋，福建巡抚朱钦相遣巡海道蔡善继招抚郑芝龙。芝龙降。寻复叛去。
先是，善继知泉州府。芝龙幼戏掷瓦石越府墙，误中善继帽。善继遣役捕至署。芝龙父绍祖，府吏也。入跪请罪。善继笑而释之。及芝龙陆梁海上，善继已罢归。巡抚朱钦相欲得素识芝龙者遣往抚谕。有告其事，遂奏起善继为泉州巡海道，令作书招芝龙。芝龙听命。陈衷纪等不欲降，自以船十二艘回台湾，惟芝龙兄弟率众诣泉州。善继待芝龙颇倨，且促其缴报战船兵器。芝虎谓芝龙曰：『道宪不过欲散我党与耳，安望其有格外恩乎。苟失势，祸福未可知，兄宜图之』。芝龙然其言，夜三鼓乘潮而去。
都司洪先春率兵击郑芝龙，先春败走。
时芝龙船泊铜山，沿海戒严。新巡抚朱一冯至，檄先春率把总许心素、陈文廉同进剿。遇芝龙于将军澳。先春鏖战，自辰至酉未决。晚潮风起流逆，心素、文廉二船漂泊不能回〈舟宗〉。先春收入旧澳镇。芝龙遣弟芝豹阴度盐墩，绕先春营后。芝龙自统大队登岸攻击。先春腹背受敌，乘潮遁入金门。
冬，金门游击卢毓英率兵剿郑芝龙，兵败被执。
朱一冯闻先春败，檄毓英与先春合剿。芝龙令弟芝虎带五艘诡作商船，陆续泊岛尾、浯岛。芝龙率战船八艘至陆鹅迎敌。甫交兵，芝龙佯败退。毓英乘势追之。芝虎尾其后，顺风而下。毓英转〈舟宗〉不及，师遂溃，为芝虎所擒。芝龙亲释其缚，厚礼之，且告曰：『某非敢拒官军，不得已耳。苟得一爵相加，当为朝廷效死力。东南半壁，可高枕矣』。毓英许之游扬。芝龙乃纵归。
七年夏六月，都督俞咨皋率舟师讨郑芝龙，大败而返。
咨皋，大猷子也。时以都督镇厦门。卢毓英自芝龙处归，入谒咨皋。咨皋责以失机，辞色俱厉，然亦畏葸不敢出兵。抚臣一冯促咨皋刻期扑灭。咨皋遣千户马胜、百户杨世爵领船二十艘出港剿捕。胜、世爵皆战殁。复遣副总兵陈希范率降贼杨禄、杨策往击芝龙。甫交兵，希范先遁，把总洪应斗、张选举力战，禄、策不敢前。应斗见势急，发火自焚。选举抱唝铳赴水死。咨皋闻报，调闽安、兴化、泉、漳诸镇兵集中左。芝龙闻之，笑曰：『咨皋纨夸子耳。徒读父书，安知兵』？已而咨皋出战，大败，逃至三叉河；闻芝龙兵不登岸，乃入厦门。
崇祯元年春正月，武平贼苏阿婆等犯上杭县，指挥刘震、百户李中季等死之。
二月，海寇郑芝龙犯厦门，同安知县曹履泰、海澄知县刘斯〈土来〉合兵击败之。
