应该说，文天祥的想法也是符合朝廷的战略意图的。益王政权建立后，对抗元大局做了新的部署：以赵溍为江西制置使，进兵邵武军（福建邵武）；以谢枋得为江东制置使，进兵饶州（江西鄱阳）；以李世逵等进兵浙东；以吴浚为浙东招谕使、邹为副使；毛统由海道至淮，约兵会合；又派傅卓等由福建向江西进兵。上述的任命大多只给个头衔，都是有职无兵，兵要靠自己去招募。文天祥相信自己能再一次白手起家，在永嘉拉起一支抗元队伍。
就在国家临危濒绝之际，文天祥拿着这个计划去找陈宜中商议时，却遭到坚决反对。为什么？按文天祥的说法，“宜中既弃临安，及三山（福安）登极，欲倚世杰复东西，以自洗濯，所以阻予永嘉之行”。临安失在他手，累陷两浙，若借助张世杰收复两浙，不仅能让他挽回颜面，好处还能落到他头上，若让文天祥抢了功，威望将盖过他，那他在朝中将被置于何地呢？
结果是，朝廷决定让文天祥去广州开府募兵。
从海上收复两浙的计划落空了。在等待广州谍报期间，他对诗集《指南录》作了增补，把从海上到永嘉，再到福安行在写的诗，编为第四卷加了进去。
但广州方向却传来了坏消息。广东经略使徐直谅本已派部将梁雄飞去湖南向元军请降，当得知南宋在福安建起了新朝廷，并颁诏各地勤王，转而反正，当梁雄飞带着阿里海牙的指令返回时，徐直谅命通判李性道、摧锋军将领黄俊拒梁雄飞于石门（湖南澧县西）。李性道不战，黄俊被打败，徐直谅弃城逃匿。广州于六月十三日降元。
去广州开府不成，又改到南剑州（福建南平）开府。南剑位于闽江上游剑溪、沙溪的汇合处，依山建城，地势险要，战略位置虽不如永嘉，却也可北保福安，西屏障闽江上游，素有“八闽屏障”之称。朝廷改任文天祥为枢密使、同都督诸路军马，经略江西。
文天祥领受了任职，于七月初四出发，至十三日到达南剑州。
在南剑州开府，与前一年组织勤王军全靠白手起家不同，此次动用了朝廷的资源，其规模和声势要大得多。“于时幕府选辟，皆一时名士。”除了旧部杜浒、吕武、张汴外，四方来投同督府的主要人物有巩信、赵时赏、陈龙复、曾凤、谢杞、许由、李幼节、吴文焕、林栋、林琦、林俞、林元甫、谢翱、缪朝宗、徐榛等，其中既有富于谋略的文官，又有久历戎旅的武将。
文官如赵时赏，宋朝宗室，其人“神采明隽，议论慷慨”，知旌县（安徽旌德）时，以一县之力抵抗元军，因功升任军器太监，临安陷落后辗转入闽，到同督府任参议官。缪朝宗，江淮人，为人精练实干，孜孜奉公，曾知梅州（广东梅县），文天祥在平江时，他义投帐下，这次又从婺州赶来追随，任环卫官，主管同督府军器。徐榛，温州人，精干勤勉，文天祥让他替代已故的金应，用他典笔札、机密。
武将如巩信，其人沉勇有谋，是久历沙场的荆湖宿将，这次奉朝廷之命率军随府，任都统制、江西招谕使。另一个林琦，既能带兵，又有文才，元军围临安时，像杜浒一样，曾招集赭山（浙江萧山东北）义军投于文天祥帐下，后带领水军在海上抗元，此次也入幕听命。
许多福建的忠义才学之士，也纷纷投效同督府。泉州老臣陈龙复，文天祥的同榜进士，官至行太府少卿、福建提刑，以敦厚、清俭著名，很有声望，在同督府中任参议官。长溪青年谢翱，擅长文章，听说文天祥开府南剑，一如文天祥倾家荡产以作军资，招集乡人数百从军，任咨事参议。还有谢杞、许由、李幼节等人，都是进士及第的名士，在同督府任秘书、架阁等官职。
赣州、吉州的勤王军旧部及乡人，闻讯也陆续前来相投。文天祥少时老师曾凤从衢州来投，此前曾任衢州教授、国子监丞，文天祥不敢把他看成属吏，以师道尊之。还有许多旧部如张云、陈继周在赣州、吉州等地暗中联络，义师一到，就立即举旗响应。
文天祥开府抗元，民心呼拥。东莞义士熊飞起兵投奔南剑府，景定五年（1264）特奏进士李春叟写诗送行，云：“龙泉出匣鬼神惊，猎猎霜风送客程。白发垂堂千里别，赤心报国一身轻。划开云路冲牛斗，挽落天河起甲兵。马革裹尸真壮士，阳关莫作断肠声。”情深义重，壮怀激烈。
同督府初立，文天祥即派杜浒前往温州、台州，吕武前往江淮。文天祥原先之所以要在永嘉开府，就因为他还想着与江淮宋军连兵大举，收复两淮和两浙，那儿还有苗再成、杨师亮、李庭芝这样的拥兵守国的将领，李庭芝虽不容自己，却也拒敌不降。还有，自镇江逃脱前往福安途中，他亲身感受到那儿民心可用，豪杰义士众多，像江淮间不要金钱只要一张批帖的管船人、稽家庄的统制官稽耸等，温州、台州和处州的张和孙、牟大昌等众多豪杰自不必说。文天祥派出他俩，一是到那儿招兵筹饷，一是去“结约江淮道”，为连兵大举加强联络。
由此可看出，文天祥的战略姿态是北上，是进攻，是收复失地。
可就当他积极招兵聚粮，结约江淮，殚精竭虑昼夜筹划军事反攻之时，朝廷下了一道命令，要他“严趣之汀”，要他马上到汀州（福建长汀）去。
这是因为七月之后的战局又发生了变化。前方抗元重镇扬州的粮道被阿术掐断，处境更加险恶，朝廷要李庭芝到福安赴任右丞相的诏令到达，李庭芝奉诏与姜才领兵七千赴泰州，准备从海路去福安。不料他前脚刚走，留守扬州的制置副使朱焕即于七月十二日以城降元。阿术追击李庭芝到泰州，把泰州团团围住，骁将姜才背部的疽痈发作力不能战，偏将孙贵、胡惟孝等开门出降。李庭芝投莲池自杀，水浅不死，与姜才一起被俘押至扬州。阿术本想劝降并重用他俩，但叛将朱焕怕他们今后不容自己，对阿术说扬州交战死了那么多人，都是他俩造成的，怎能不杀呢？两人遂于八月十三日被杀害。
李庭芝早年投身名将孟珙帐下，才勇毕露。孟珙死前，留下遗嘱推举贾似道替代自己，并把李庭芝推荐给了贾似道。李庭芝在抗元作战尤其是在襄樊之役和守卫扬州中，英勇善战，屡次怒杀劝降者，不失忠节大义。但也有可诟病之处，驱杀文天祥就是一例。文天祥有诗曰：“北来追骑满江滨，哪更元戎按剑嗔。不是神明扶正直，淮头何处可安身？”元戎即指李庭芝，文天祥自镇江脱身后与死同行，李庭芝脱不开干系。不知是否此经历影响了文天祥对李庭芝的看法，文天祥说：“李庭芝在扬州十余年，畏怯无远谋，惟闭门自守，无救于国。”说他畏怯无远谋，是否冤枉了他？据《宋史·姜才传》记载，当扬州粮绝，元军诱降时，“庭芝以在围久，召才计事，屏左右，语久之。第闻才厉声云：‘相公不过忍片时痛耳！’左右闻之俱汗下。才自是以兵护庭之第，期与俱死”。似说李庭芝犹豫动摇，被姜才劝止。落入敌手后，阿术指责李庭芝不降，姜才挺身道：“不降者我也！”似也可作印证。文天祥给李庭芝的盖棺定论是：“虽无功于国，一死为不负国矣。”
此外，还可看看文天祥对姜才的评价。他说，姜才乃“淮东猛将，扬州前后主战，皆其人也。及泰州破被执，虏爱其才勇，啖以官爵，不肯降，骂诸负国者。临刑，含血以喷，骂虏不绝口。其英风义烈，淮人言之，无不伤叹。惜哉！”与对姜才的激赞相比，文天祥对李庭芝的评价实在不高。
“东南兵力，尽在江北，金城汤池，国之根本。高（达）以荆州降，夏（贵）以淮西降，李（庭芝）死，淮东尽失，无复中原之望矣。哀哉！”正如文天祥所说，扬州既失，真州苗再成城破而死，通州、滁州、高邮、处州、温州等相继降元，抗元形势迅速恶化，十月，元军在南宋降将王世强引导下，向福建发起了大举进攻。朝廷赶紧要文天祥的同督府南移汀州。文天祥要求到永嘉开府，是想着收复两浙和两淮。朝廷要他去广州，而南剑，而汀州，是为了让他护驾朝廷南逃。
文天祥十一月移师汀州。
刚在汀州扎营，刘沐就带领一支勤王军风尘仆仆赶来会合。继而泰和的萧明哲、赣州的陈子敬也起兵来会。文天祥因他们的到来极为兴奋。刘沐是文天祥的少时挚友，沉实有谋，圆机应变，在江西忠义之士中颇有号召力，继续担任督帐亲卫的旧职。萧明哲是吉州贡士，生性刚毅，遇事有胆气，明于大节，任督干架阁监军。陈子敬以资力雄乡里，为人忠信有谋，任督干监军。他们都是文天祥的股肱亲随。
刘沐是头一个到的。当晚，文天祥备酒接风与他长叙。他告诉文天祥，自文天祥入元营被扣，他便因勤王军被遣散回到家乡庐陵，当听到文天祥在南剑州开府的消息，他立即招集勤王军旧部前来投效。文天祥问他知不知道张云的情况。刘沐说，张云被遣散率部回到家乡，见吉州城已降元，于七月间率部夜袭元营，大战南栅门，杀敌数百，恰遇一支元军路过，义军腹背受敌，苦战到黎明，撤到江边饮水休整，受元军冲击，张云与众部下溺水而死。文天祥叹气道：休矣！又说陈继周遭遣回家乡后，串联旧部，密图再举，小皇帝即位后，任他知南安军（江西大余），自己曾派人联络他和张云做好响应举义的准备，不想八月陈继周遭元军袭击，被俘不屈而死。
文天祥垂泪道，在南剑州开府时，张云、陈继周在赣州、吉州积极联络义士，准备随时起而响应，谁料如今已是阴阳两界。说至此，两人悲痛不已，起身举酒酹地，祭奠忠魂。
两位志同道合的战友几乎谈了一整夜，文天祥意犹未尽，又作诗一首，抒发患难重逢的万千感慨：
万里飘零命羽轻，归来喜有故人迎。
雷潜九地声元在，月暗千山魄再明。
疑是仓公回已死，恍如羊祜说前生。
夜阑相对真成梦，清酒浩歌双剑横。
自己历经九死一生，想不到今日还能活着与久无音信的刘沐重逢，真好像是被西汉神医仓公救渡，恍如西晋开国元勋羊祜复现，前生今世，云里梦里，把酒共议抗元大计，誓以雷破九地惊天宇，月出千障照九州。
汀州位于崇山峻岭之间，文天祥在这里作出的军事部署，仍是前出进攻的姿态：他派遣参谋赵时赏、咨议赵孟溁率一部前往宁都，从元军手中夺回县城，命已在那儿聚兵的江西招谕副使邹接应。命参赞吴浚率部攻取雩都（江西于都），锋指距雩都不远的赣州城；另派唐仁与赣州城内义士联络；陈子敬回赣州招集义兵，控制赣水下游的皁口（赣江口岸），断绝元军增援赣州的水路；策应吴浚攻取赣州。此外还派出武冈军教授罗开礼夺取吉州永丰县等。这一系列举措意在向江西打开出路，扭转抗元的被动局面。
然而文天祥的抵抗和进攻是孤悬的。
十一月中旬，元军攻占了建宁府（福建建瓯）、邵武军、南剑州，福安屏障尽失。此时行都福安尚有宋军十七万人，民兵三十万，淮军万余，但陈宜中和“惟务远遁”的张世杰不敢与元军决一死战，护持着小皇帝赵昰、卫王赵昺及太后杨氏乘船逃往海上。弃城逃到福安的知南剑州王积翁作为元军内应，与知福安府王刚中一道献城投降。
行朝一跑，再挫宋军本已岌岌可危的抗元信心，各郡县守将或逃或降或败，东南守备土崩瓦解。景炎二年（1277）元月，元军进逼汀州，文天祥本想据城抗敌，但同督府军大部受命在外，汀州守将黄去疾听说行朝逃往海上，按兵不动，有叛变迹象，不得已将同督府迁往漳州龙岩。
文天祥的江西攻略也受挫。派去攻打宁都的赵时赏、赵孟溁失利返归。邹在宁都被俘，改名换姓假称卜课算命先生得以逃脱。夺取永丰县的罗开礼也被俘，死在吉州的监狱中。另外，同督府初立时派往温州、台州招兵筹饷的杜浒，往江淮联络义士的吕武也不得不南返，辗转于寻归同督府的途中。
原先派去攻打雩都的参赞吴浚也来到龙岩。但他不是来归府请命的，他已同黄去疾一道投降了元军，他是受元将李恒派遣来诱降的。
文天祥大怒，断然在军前将他绞杀。
