南直：南直隶的简称。明代称直属于京师的地区为直隶。自明成祖永乐初建都北京（今北京市）后，又称直属于北京的地区为北直隶，直属于南京（今南京市）的地区为南直隶。南直隶辖区相当于现在的江苏、安徽两省。上海：今上海市。节：守节。矫挚（治zhì）：矫健勇猛。挚，通“鸷”，凶猛。饶：富于。英分：天分。蹑（聂niè）：轻步爬登。雉（志zhì）：“雉堞”的简称。城上矮墙。龙华寺：在上海市西南郊。陟（秩zhì）：登高。趺（肤fǖ）：盘膝而坐。顶盘：塔建筑的顶部分有盘，称作“顶盘”。层折：一层一层地转折。进凡思五六指，乃祝笔：深入思考，总要想到五六层意思，才开始动笔。指，借为“旨”。祝，属。这句说：读他的文章，要不辞辛苦，一再深思，虽然仓猝之间还不能体会，可是文中所说的事，实际上是可以试验施行的。顾盼：警觉。仞：古时以周尺八尺为“仞”。千仞：八尺。这句意思说：他能够立在很高的高度来思考事物。北雍：北直隶的国子监（太学）。雍，“辟雍”的省称，太学。顺天：顺天府，今北京市。首解：就是“解元”，乡试第一名的称呼。徐光启于万历二十五年（）举顺天乡试第一。甲辰：万历三十二年（）。庶常：“庶吉士”的另称。明代在翰林院高吉士官，选进十之优于文学、书法者担任。约以二言：归结为两句话。万历：明神宗年号（—），其最后一年，自八月起，改称泰昌元年，为光宗年号。庙谟：国政。臣劳：大臣的职事。颓：败坏。优尊：养尊处优。此四字：指“求精”、“责实”。可呼沉寐：可以唤醒沉睡。长计：上策。甫：刚才。释褐（赫hè）：换去布衣穿上官服，指考中进士（旧制新进士到太学行“释褐”礼）。褐，粗布衣服。一口裕之也：（徐光启）一句话就充分地把它说出来了。简讨：翰林院的官名，职位次于编修。“简”原作“检”，因避明思宗朱由检的讳，改为“简”字。徐光启于万历三十五年（）任翰林院简讨。礼闱：担任考试官。因为考试进士的事务由礼部的管理，故称“礼闱”。徐光启于万历四十一年（）任考官。魏南乐：就是魏广微。因他是南乐（今河北南乐）人，故称为魏南乐。为人狡猾，没有气节，宦官魏忠贤得势后，他以同乡、同姓依附于魏忠贤，官至礼部尚书兼东阁大学士，参与机务，更加谄附忠贤，陷害好人。崇祯初年，削夺官职。不协：不合。移病：移书称病，即上书请病假。津门：天津。徐光启于万历四十一年（）八月托病请假，赴天津屯垦。间疆：边地、荒地。《农政全书》共分十二个部分，计六十卷。这里所说的“十二卷”，实际上是“十二门”。春坊：太子官的称呼。有左、右春坊。赞善：太子官属的名称。有左、右赞善。徐光启在万历四十五年（）任左春坊左赞善职。敕：皇帝的诏令。庆藩：庆王。奉命册立诸王，照例受到赠礼。庆王援例送二百金及币、仪等物给徐光启，光启都退还了。于此可见他的廉洁。万历四十六年（），清兵攻占抚顺，明朝东疆紧张。明廷派杨镐（号hào）经略辽东。杨领兵十三万，分四路进兵：马林帅北路军，杜松帅西路军，刘綎（厅tīng）帅东南路军。这种布置，战绩很长，兵力分散，在战略上是很失策的。策：预料。杜将军：杜松。杜松的部队出抚顺，沿浑河左岸进苏子河谷，至新宾西吉林崖，中清兵埋伏，全军覆没，杜松战死。刘綎军也相继大败，明军全线溃退。这时是万历四十七年（）三月。训兵：练兵。通州：北通州，今北京市通县。詹事府：管理太子家庶务的衙门。设詹事、少詹事职。徐光启于万历四十七年（）九月升詹事府少詹事职。河南道：辖河南府（府治在今洛阳）及汝州（今河南临汝）。御史：监察官。更番：军队调访。神庙崩：明神宗在万历四十八年（）七月去世。予告：旧时朝廷官员年老归家称“予告”。籍：原籍。天启：明熹宗年号，元年为公元年。辽警：（清军入侵）辽东边防告警。这句说：起用徐光启参与军务。知，主管。熊廷弼：字飞百，江夏（今湖北武昌）人。杨镐被清军打败后，代镐经略辽东。劳子：劳苦的儿子。予：给。辽阳：今辽宁省辽阳市。海、盖四州：海州卫（今辽宁海城县）、盖州卫（今辽宁盖平县）、复州卫（今辽宁复县）、金州卫（今辽宁金县）。第：但是。断：决人计。浪营城外：轻率地布防在城外。寒：使单薄。指：宗旨、规划。庙：朝廷。成画：确定的计划。党事：党派的意见。左：违。沈、辽：沈阳、辽阳。广宁：今辽宁北镇县。经、抚：经略、巡抚。当时院落经略为熊廷弼，广宁巡抚为王化贞。按理王化真应受熊廷弼的节制，但因委任不专，王化贞不听熊廷弼的指挥。熊主守，王主攻。大坏：大局的败坏。台：御史台的简称。抨：抨击。疾归：称病辞归。癸亥：明熹宗天启三年（）。《神庙实录》：即《神宗实录》。“实录”是记载一朝帝王史事的官书，在一个帝王的去世后编修。魏珰（当dāng）：指魏忠贤。珰，本是帽子上的一种装饰，宦官所戴的帽，饰有金珰，故以“珰”为宦官的别称。南乐广微：指魏广微。通谱：同姓通谱，表示是一家人。参见前注。固不应：徐光启坚持不与魏广微等同流合污，互相勾结。嗾（sǒu）台臣论劾：指使那些御史弹劾（徐光启）。崇祯初：崇祯元年是公元年。这时，明思宗登位，歎除弊政，斥魏忠贤，起用忠正大臣。经筵：讲经官和帝王联讲认经史。称为经筵。这句说：上奏章建议，在经筳中除了时论经史外，同时也评论目前军国大事和古今政治沿革利弊。太子宾客：官名。职务是对太子进行调整护和规谏。副总裁：副总编辑。插：蒙古部落插汉（也写作“察罕”）的简称。居住在原察哈尔地区。偤：偤长。虎墩兔：插汉部族打来孙的四世孙，很为强悍，有时率领他的部族犯明产疆，有时又与清军火敌。宣、大：宣化、大同。虎墩兔犯宣、大，是崇祯元年（）事。唯臣所须：让我来安排用途。须，需用。牵沮：牵制和阻碍。执：担任。咎（救jiù）：过失。改本部左：改任礼部左侍郞。前面说，“拜礼部右侍郞”，故这里的“本部”指“礼部”。遵化不守：崇祯二年（）十一月，清军攻下长城在北京紫禁城内。垛（朵duǒ）：土堆的防御工事。毖（避bì）：谨慎，这里指妥善准备。走勅：派人持令奔走。招徕：搜集散兵和逃亡的老百姓。袁崇焕：明末名将。以兵部尚书职督师蓟（河北）、辽（辽东）。辽左：辽东。倖战：徼幸作战。辛未：崇祯四年（）。大凌河：指大凌河城，在辽宁锦江县东四十里（现在是大凌河店，沈、山铁路经过它），明初所建。明末，清兵屡在此处与明军作战，至崇祯四年攻下后，城墙被清军毁掉。孙元化：江苏嘉定人，天启举人。徐光启的学生，精通西洋火器。崇祯初年，任登、莱巡抚。登州：登州府，位在山东半岛东端，治所当今山东蓬莱县。吴桥之变：崇祯四年（）十月，登、莱巡抚孙元化的部下鋀州游击孔有德，率部属千余人循陆路赴宁远卫（今辽宁兴城县）增援，闰十一月，行至吴桥（今河北吴桥县），逢大雪，无所得食，发生兵变。史称“吴桥之变”。酷水火：意思是说：斗争得很严重、残酷，有如水火不相容。逢：逢迎。自尽：自己尽自己的能力。将：将事，即办事的意思。东阁：明朝的大学士都带殿、阁的头衔，其中之一是东阁。孙承宗：字稚绳，高阳人，明末名将，通晓边事。天启初年，累官兵部尚书，自请以原官督理辽东防务。行边：督理边防事务。老谢事：年老请求退休。太保：位望高重的官职，为三公（太师、太傅、太保）之一。文渊阁：明朝皇家藏书阁名。享：祭祀。太庙：帝王的祖庙。释奠：设置酒食来祭祀。先师：孔子。代表朝廷祭祀太庙与先师，是德高望重的表征。李天经：精通算法、天文。初为山东参政，后任光禄寺卿。与徐光启、李之藻及西洋人龙华民、汤若望等同修《崇祯历书》。完成修订历法的事务，诚：叮嘱。年七十有二：“二”原作“三”，今依各种传记资料和《后乐堂徐氏家谱》订正。少保：也是位望高理的官职，为三少（少师、少傅、少保）之一。裨：益。邦本：国家的根本。两廕（印yìn）：两代借廕庇而叙官。廕，同“荫”。旧时的制度凡是子孙因先世的勋劳而鍂叙官职的，称为廕。澹：同“淡”。无间：没有间隔。这各大说；不管睡眠和吃饭时候，都不忘记研讨富国强兵的学问。先子：称去世的父亲。徐光启的父亲名思诚，字怀西。勇退：勇于退让。就是“不争先”的意义。权之：权衡于。火攻：用火器（指火炮）作战。漕河：水运叫做“漕”。明朝北都的官粮、军粮，都依赖大运河从东南运来，故称大运河为“漕河”。二年：“二”原误作“元”，据徐光启《治历疏稿》及《明史·庄烈帝本纪》、《明史·历志》校改。钦天监推算刻数不合：崇祯二年五月朔（年月日），日蚀。钦天监依《大统历》推算蚀三分二十四秒，依《回回历》推算蚀五分五十二秒，都不合。徐光启依西洋历法预推：顺天府（今北京市）蚀二分多一点，应天府（今南京市）蚀八分多一点，琼州（今海南岛海口市）全蚀，大宁（今内蒙古平泉县北）以北不蚀。证验下来，完全符合。光启受命监修历事：崇祯二年五月朔日食，钦天监依旧法推算不合后，礼部奏请修改历法，推徐光启、李之藻和西洋人龙华民等任其事。崇祯帝即予批准。徐光启就开设历局，翻译历书，并进行观测。龙华民：NicolausLongobardi，意大利西济利亚人，生于年，卒于年。年来华。译有《地震解》等书。汤若望：AdamSchallvonBell，日尔曼人。生于年，卒于年。年来华。译有《浑天仪说》、《交食历指》等天文、历法书甚多。上《历书》前后共三十一卷：历局所上《历书》，前后五次，总数一百三十七卷。这里写“三十一卷”，是不完全的统计。交食：日、月蚀。太阳和月亮同在黄道和白道的交点附近某一范围之内，便会发生日、月蚀，故称日、月蚀为交食。计十二目：《农政全书》分十二个部分，就是：农本、田制、农事、水利、农器、树艺、蚕桑、蚕桑广类（讲木棉和麻）、种植、牧养、制造、荒政。立虚、实二法招徕之：招徕民众垦荒，徐光启建议虚、实二法：虚法是给以爵、禄，爵是虚名，禄是垦者自己耕种的果实，也是虚的；实法则为在科举考试制度中，另立屯额乡试，给以特殊的科名机会，借此来鼓励人口繁密的地方移民屯垦。惟：谋，考虑。漕议：徐光启著《漕河议》（文见《明经世文编》卷四百九十一），讨论漕河的利害，并建议治黄河的对策。因为漕河的一段夺去了黄河故道。靡：靡费。这句说：国家贫困的原因，就是由于漕运运费太大，西北一地坐在那里靡费了东南大量的财富。滋：灌溉。会通河：即今山东省东平县安山镇到临清市之间的运河。元世祖至元二十六年（）开筑，全长二百五十余里，上连御河（今卫河），下接泗水；引汶水通航。禹河故道：相传夏禹所治河（指黄河）的下游老路，当在山东东平境。“禹河故道”四字原残缺，据《漕河议》补。准望：古代的地理学和测量学名词，就是“方位”。地形：“形”字原残缺，所《漕河议》补。经、权：永久办法和临时措施。《漕河议》说：“定形为经，时变为权。”我可待河：“我”、“河”两字原残缺，据《漕河议》补。而河不能为我难：徐光启的治河主张是：不可以急于求功。但不急则影响到漕运，将使北都发生粮食恐慌。所以要采用“支运”的办法，来解决两者之间的矛盾。这个矛盾解决后，那末就形成“我可待河，而河不能为我难”了。支运：漕河分段驳接运输，叫做“支运”；与一船直运叫做“长运”的相对而言。节次：调度。志：《罪惟录》的一部分是“志”，有《天文志》、《历志》、《屯田志》、《漕志》、《兵志》等。这句说：徐光启的各种奏议，杂见于各“志”中。宦邸：官邸。萧然：寂寞得很。敝衣：破旧的衣服。袭：套。手草居：即起居。约啬（涩sè）：简朴。姬媵（应yìng）：侍妾。厅事：厅堂。旋马：转过马来。这是形容厅堂的狭小。毋（吴wú）空期明日：不要放松今天，而空推托到明天。夙：向来。主退：主张退让。就是前面所说的“此先予‘勇退’遗教”。作解：作有解说。这篇文章现在不存。这句是徐光启的预言。意思说：到了他的孙子一辈，便免不了要做亡国奴了。审：果真。这句是作者查继佐的感慨。意思说：（徐光启不幸而言中，后来明朝亡于清了。）难道这果真是天意吗？疏（庶shù）：我国古书的一种体裁。它的意义是疏通或说明。《甘藷疏》就是“甘藷浅说”的意思。
查继佐，字伊璜，浙江海宁人。生于明万历二十九年（），卒于清康熙十五年（）。崇祯六年（）举人。南明鲁王授以职方主事。明亡后，不再出仕。晚年辟敬修堂于杭州的铁冶岭，著书其中，学者称敬修先生。
查继佐在北都倾覆（崇祯甲申，即年）以后，就立志编写明朝一代的历史，经历二十九年，至康熙十一年（）完成，名为《罪惟录》，全书分纪、志、传三体，共一百零二卷。在撰著期中，于康熙元年（）遭庄氏（廷鑨）史狱，牵连被捕，后由广东提督吴六奇营救出狱，仍不舍前志，写成全书。但鉴于史祸，不敢传布。原稿历经秘密保存，幸未散佚，至年才由涵芬楼影印行世。清代官修的《明史》，由于撰写时趋避忌讳，史料价值很受影响。《罪惟录》虽是私人所撰国史，但是多存遗文逸事，足以订补《明史》的地方极多。
查继佐所作《徐光启传》，在《罪惟录》卷十一下《经济诸臣列传》中，叙事及概括徐光启的政治与学术成就，远远超过《明史》卷二百五十一的本传。徐光启是一位爱国的科学家，在明末东疆危急的时代，曾迭筹练兵抵御外患。可是《明史》因为这些触犯忌讳，只是草草表过。查继佐在撰写《罪惟录》时，系故国之思，故特别着眼于徐光启的战略思想和高尚风格，而能以生动的笔触，栩栩如绘地把它描写出来。
这篇传记中有少数的纪年错误，又《罪惟录》原稿因保存年久，遭虫鼠啮伤，间有缺字。现在考查有关的材料，加以订补，均在注文中说明。
