虽然“五藏”与“五脏”同名，但这两个词在本意上与现代解剖学上的五脏却不同义，这一点读者们必须切记。因此人们在读《内经》时，最好将所有的“五脏”都读作“五藏”，这样就可以避免引起混乱。其实从《内经》的篇目标题可知，《内经》中直接用到“五藏”的篇目有很多，《五藏生成篇》、《五藏别论》、《六节藏象论》、《玉机藏真论》、《藏气法时论》等。而整部《黄帝内经》没有以“五脏”而立篇名的。因此我们认为，无论在何种情况下，五脏在内经中都应该称五藏，而不应该称五脏。
第二、中医五藏与解剖五脏不是一回事。
虽然《内经》之五藏指的是心、肝、脾、肺、肾，但它们绝不是解剖意义下的五脏，也可以说《内经》五藏并非血肉五脏。
1、《内经》五藏与解剖五脏不对应。人体心肝脾肺肾五个器官，在解剖上已经相当明确，它们在腹腔中有固定的位置，是不可更改的。但《内经》五藏不能对应解剖学上的结果，“左肝右肺”就与解剖学相违背。
2、《内经》五藏在功能上要大于解剖五脏。虽然五藏与五脏所指对象相同，但在功能上，五藏要大于五脏。例如，《内经》在论述心时，除了“心生血”、“心主脉”似乎与解剖学的心脏相同外，其它功能一概不同：
《素问?宣明五气》：“五藏所藏，心藏神……”
《素问?本病论》：“心为君主之官，神明出焉，神失守位，即神游上丹田。”
《素问?宣明五气篇》：“心藏神”、“心主脉”。
《灵柩?邪客》：“心者……精神之所舍也。”
《灵枢?脉度》：“心气通于舌，心和则舌能知五味矣。”
《素问?脉要精微》：“心为牡藏，小肠为之使，故曰小腹当有形也。”
《灵枢?本输》：“心合小肠，小肠者，受盛之腑。”
从上引《内经》关于心脏的功能，它明显与解剖学心脏功能不对应，要远大于解剖功能的范围，其它各藏也有这类情况。所以从功能上看，《内经》五藏与解剖五脏就不是一回事，它们分属于两个不同的系统中。
第三、五藏应该化义为神、魂、魄、意、志。
解剖五脏指心肝脾肺肾及相关的生理功能，这点很确定。但《内经》五藏却不仅仅指心肝脾肺肾，或者说它主要不是指心肝脾肺肾。那么五藏主要指什么呢？
现代有些人认为，《内经》中之所以要用“藏”，取意为五脏深藏于体内，外面看不见，故曰藏。持这种看法的人还真不少。但这样就不对了，大肠、小肠、三焦、胆、胃、膀胱等六腑同样深藏于人的体内，没有见过谁的胃长在体表的，为什么六腑不叫“六藏”呢？可见用字面意思来解释“五藏”是行不通的。
《内经》之所以称为五藏，那是有特指的，它指的就是神、魂、魄、意、志五神，称为藏象五神，或五藏神，除此之外的藏精、藏气、藏血都与藏神有关。
《素问?调经论》曰：“心藏神，肺藏气，肝藏血，脾藏肉，肾藏志。”
《灵枢?本神》曰：“肝藏血，血舍魂；心藏脉，脉舍神；脾藏营，营舍意；肺藏气，气舍魄；肾藏精，精舍志。”
《灵枢?经水》曰：“五脏者，合神气魂魄而藏之。”
《灵枢?本藏》曰：“五藏者，所以藏精神血气魂魄也。”
《灵枢?邪客》曰：“心者，五藏六腑之大主也，精神之所舍也。”
…………
或者有人认为，神魂魄意志代表的只是人的精神现象，不能作为人体某种器官名称。其实这是个习惯问题，现代人们一提到床，马上会想到睡觉时的床，脑海中不会再有第二个念头，其实在唐代以前，当人们说床时，指的却是某种板凳，这种板凳是从西域传过来的，故而又称“胡床”。根据《内经》的通篇理论构架，“五藏”可以通义为神、魂、魄、意、志。最主要的是，在《内经》中“五藏”是个系统，而不仅仅是五个点或者五种精神现象，它们是一个运作正常的系统，完全有器官的功能与作用，只是很难讲述它们的形态组织。
