基于以上的进展，美国和巴基斯坦于1997年2月28日通告世界贸易组织争端解决机构，双方已就有关的问题达成满意的解决，美国正式撤回提起争端的申请。1997年6月9日，美国贸易代表宣布，终止有关的调查，将依据贸易法第306条监督巴基斯坦执行TRIPS协议的有关规定。
在1998年度和1999年度的“特别301条款”审查报告中，美国贸易代表都提到，巴基斯坦缺乏对于药品的产品专利保护，专利法中有关方法专利的保护期也与TRIPS协议不一致。美国希望巴基斯坦采取必要的措施，在2000年1月1日到来时完全执行TRIPS协议的规定。
看来，美国与巴基斯坦有关知识产权的争端并没有真正结束。
三、土耳其
在知识产权的保护和相关的市场准入上，美国与土耳其的争端一直处于比较突出的地位上。从1992年到1999年，在美国贸易代表的“特别301条款”年度审查报告中，土耳其连续八次被列入“重点观察名单”。这表明了美国对土耳其知识产权保护状况的关注。例如，1995年度的审查报告说：“由于缺乏现代的版权和专利立法，土耳其一直被列入‘重点观察名单’。现行版权法实施无力，盗版普遍存在。由于药品不能获得专利，土耳其也是侵权药品的主要生产者。”报告还说，在与欧盟进行的关税联盟谈判中，土耳其承诺在未来的几年里，将其知识产权法律与国际规范接轨。
在1997年度的“特别301条款”审查报告中，美国贸易代表又具体指出了土耳其知识产权法律制度中存在的种种问题。报告说：“由于知识产权法律上持续存在的不足和实施努力的无力，土耳其仍然处于重点观察名单中。作为土耳其加入与欧盟的关税联盟的一部分，土耳其同意改善其知识产权保护。然而，土耳其的版权法和专利法仍然存在着缺陷，在许多方面与TRIPS协议不一致。此外，实施努力仍然缺乏，其结果则是盗版和专利侵权广泛存在。对于放映外国电影所获的收入，土耳其仍然保留着歧视性的25%的市政税，这与1994年关贸总协定第3条规定的国民待遇不符。”
美国与土耳其较为激烈的，引发了“特别301条款”调查的冲突，就是围绕着歧视性的电影门票税而展开的。
根据1994年关贸总协定第3条的规定，当某一世界贸易组织成员的产品进入另一成员的领域后，另一成员不得加征高于本国同类产品的税收或其他费用，不论是直接的还是非直接的。世界贸易组织的成员也不得使用征税或征费的方式，对国产产品提供保护。而土耳其的“市政税收法”则规定，对于放映外国电影而获得票房收入征收25%的税，但对于放映国产影片的票房收入则不予征税。显然，土耳其仅对外国电影的票房收入征收25%的税，是不符合1994年关贸总协定第3条规定的。
1996年6月12日，就土耳其政府的某些法律、政策和做法可能导致对美国影片的歧视性待遇，美国贸易代表自动发起调查，以确定有关的做法是否可受贸易法“301条款”的制裁。同日，依据1994年关贸总协定第22条和《关于争端解决规则和程序的谅解》第4条，美国正式要求与土耳其政府磋商。经过数轮磋商，土耳其同意消除歧视性的税收，对外国影片和国产影片征收同样的税。在磋商中，虽然世界贸易组织的争端解决小组已经成立，但土耳其在争端解决小组未开始工作就与美国达成了协议。美国也随后撤回了自己的申请。1997年7月17日，美国和土耳其向世界贸易组织的争端解决机构通报了争端的解决。1997年11月21日，美国贸易代表宣布，终止对土耳其的调查案，依据贸易法“306条款”监督土耳其承担其义务。
1997年12月19日，美国贸易代表宣布，土耳其已经在有关的问题上执行了双方达成的协议。因为，土耳其的部长会议已经颁布了一个条例，对外国影片和国产影片征收同样的税。
然而，美国与土耳其在知识产权上的争端并没有因为电影票房收入税的解决而解决。1998年度的“特别301条款”审查报告说，经过对土耳其的不定期审查，美国贸易代表在1998年1月16日宣布，土耳其仍将保留在“重点观察名单”中，但在土耳其改进其知识产权法律体系以前，不考虑增加其依据“普惠制”的优惠待遇的要求。显然，解决有关电影票房收入税，只不过是能够让土耳其继续保留在“重点观察名单”中，不至于上升为“重点外国”。而且，不再增加依据“普惠制”的优惠待遇，在某种程度上也算是一种制裁。1998年度的审查报告还说，版权法和专利法的修正案尚未通过，而现存的法律又存在着许多缺陷，在很多方面与TRIPS协议不一致。土耳其应当采取有效的实施措施，打击普遍存在的盗版，包括对盗版者加大刑罚力度。“土耳其未来的依据普惠制的优惠待遇，将依赖于在这些问题上的进展。”
在1999年度的“特别301条款”审查报告中，美国贸易代表仍然指出，土耳其在知识产权保护方面进展缓慢。版权法尚未修订，对侵权者处以的刑罚也太轻，其结果则是盗版普遍存在。
虽然土耳其已经采取措施，提供对于药品的产品专利保护，但还没有建立专门的知识产权法庭，以审理对版权、专利和商标的侵权。“土耳其的知识产权法律不完全符合TRIPS协议的规定，而这又必须在2000年1月1日使之符合。只有当土耳其政府修订了法律、有效地解决了版权实施的问题，它依据‘普惠制’的优惠待遇才能得以增加。”
看来，美国与土耳其知识产权争端的解决，包括美国完全恢复土耳其依据“普惠制”所享有的优惠待遇，还有待时日。
第三节巴西、阿根廷、洪都拉斯和巴拉圭
巴西、阿根廷、洪都拉斯和巴拉圭地处拉丁美洲，在地理上与美国比较接近。因而，美国对这些国家的知识产权保护和相关的市场准入更为敏感，有关的争端也显得更具有某种特殊性。
一、巴西
早在《1988年综合贸易竞争法》制定“特别301条款”以前，美国与巴西在知识产权保护方面的冲突就已经很尖锐。1987年6月11日，美国的“制药协会”提出申请，诉称巴西缺乏对药品的方法专利保护和产品专利保护是不合理的，对美国商业造成了负担或限制。1987年7月23日，美国贸易代表就巴西的有关做法发起调查，并要求与巴西磋商。1988年2月，美国官员与巴西政府举行磋商，但巴西政府未做出对药品提供产品专利保护的承诺。1988年7月21日，美国总统确定，巴西的有关做法是不合理的，对美国的商业造成了负担或限制，应当依据“301条款”采取必要的措施。美国总统还指示美国贸易代表就是否对来自巴西的某些产品进行制裁举行公众听证会。1988年9月8日至9日，美国贸易代表举行了有关的公众听证会。1988年10月20日，美国总统依据贸易法“301条款”的授权宣布，对来自巴西的某些纸产品、非苯类药品和日用电子产品，按价加征100%的关税，价值达3900万美元。制裁措施于1988年10月30日起生效。由于受这项报复措施的影响，在1989年和1990年的上半年，巴西的这几类产品几乎没有进入美国。
迫于美国的贸易制裁措施，巴西政府在1990年6月26日宣布，将通过立法对药品提供产品专利和方法专利的保护。巴西政府还同意，将确保在1991年3月20日以前向国会提交有关议案，并寻求议案获得批准和在议案生效后立即予以实施。基于巴西政府以上的承诺，美国贸易代表确认，巴西政府正在采取令人满意的措施，以消除有关的不合理做法。1990年6月27日，美国贸易代表宣布，自1990年7月2日起终止加征关税的制裁措施，并密切监督巴西政府制定该项立法的努力。
“特别301条款”生效后，美国贸易代表在1989年和1990年没有确定任何国家为“重点外国”的情况下，两度将巴西列入“重点观察名单”中。在1991年和1992年度的“特别301条款”审查报告中，巴西又是两度被列入“重点观察名单”。由此可见，在美国贸易代表的年度审查报告中，巴西一直处于较为突出的地位上。
在1993年4月30日发布的“特别301条款”审查报告中，巴西终于被美国贸易代表确定为“重点外国”。美国贸易代表指出，巴西有关知识产权的法律、政策和做法中有许多缺陷，包括：专利法中存在着许多有问题的规定，诸如专利保护客体的范围、过于宽泛的强制许可规定和实施要求、以及过短的专利保护期。没有将计算机软件作为文字作品而给予版权保护。对计算机软件侵权者的刑事处罚不足以威慑其他侵权者。对商业秘密保护不足。没有对集成电路布图设计的保护。盗版率和假冒商标率太高。
巴西在1993年被确定为“重点外国”，与1987年发起的“药品调查案”有着密切的关系。自1990年7月2日美国停止对巴西的制裁措施后，美国贸易代表一直密切监督巴西制定对药品提供方法专利和产品专利保护的立法。1991年5月，巴西政府向国会提交了有关的议案，将对药品提供方法专利和产品专利的保护。由于该议案还有一些缺陷，巴西政府又在1992年5月向国会提交了一个新议案，纠正了美国所提出的一些问题。但是，巴西政府告知美国，巴西国会考虑的将不是这个议案，而是另一个提供微弱保护的议案。在这种情况下，美国贸易代表终于在1993年度将巴西确定为“重点外国”，并发起了相关的调查。调查的一个主要目的就是让巴西对药品提供方法专利和产品专利的保护。
1993年5月28日，就巴西的某些法律、政策和做法否定足够而有效的知识产权保护，美国贸易代表发起调查，并要求与巴西政府进行磋商。1993年7月10日至21日在巴西利亚、10月4日至6日在华盛顿、11月16日至18日在巴西利亚，美国与巴西共举行了三轮磋商。1993年11月26日，美国贸易代表确认，调查涉及了复杂而繁难的问题，将确定是否采取制裁措施的最后时间延长至1994年2月28日。之后，双方的第四轮谈判于1994年1月在巴西利亚举行，第五轮谈判于1994年2月初在华盛顿举行。
在上述五轮谈判的过程中，巴西表明了在改善知识产权保护方面，以及对依赖于知识产权保护的产品提供更多的市场准入方面，它已经采取和将要采取的改革措施。这包括：改善商标、集成电路布图设计、专利和计算机软件的保护。计算机软件的市场准入。改善知识产权的实施，包括禁止侵权假冒物品的进口和加大对侵犯知识产权者的刑罚力度。在此期间，巴西国会还批准了乌拉圭回合谈判所达成的协议，包括TRIPS协议。
基于巴西政府已经采取的和将要采取的措施，美国贸易代表于1994年2月28日决定终止调查，取消对巴西的“重点外国”的确定。同时，美国贸易代表又宣布，将依据贸易法的“306条款”，监督巴西实施有关的措施。
由于巴西在实施有关承诺方面进展缓慢，在1995年4月发布的“特别301条款”审查报告中，巴西被列入了“重点观察名单”中。报告说：“巴西仍然未能足够地保护知识产权。
使巴西专利法现代化的立法仍在国会的考虑之中。虽然最近提交了有关计算机软件的议案，但还没有提出版权法的修正案。贸易代表期望巴西通过现代专利、商标和版权法案。”报告还说，美国贸易代表将对巴西进行不定期审查，评估巴西在知识产权保护方面的进展，并依据审查的结论采取适当的措施。
在美国的压力之下，在1995年和1996年初，巴西政府向议会提交了保护计算机软件和植物新品种的议案，并继续推动国会通过专利法。1996年4月17日，就在当年度的“特别301条款”审查报告发布之前，巴西国会通过了一部新的专利法，规定在一年的过渡期之后对药品提供产品专利和方法专利的保护，提供“管线保护”并限制平行进口。基于此，在1996年度的“特别301条款”审查报告中，美国贸易代表将巴西降到了“观察名单”中。此后，巴西政府又向国会提交了计算机软件保护法、版权法和集成电路布图设计保护法案，并在1997年5月通过了植物新品种保护法。
在1998年度的“特别301条款”审查报告中，美国贸易代表说：“在过去的一年里，巴西颁布了现代的保护计算机软件和版权的法律。这是对巴西1997年5月实施现代专利法的补充。
作为对这些巨大进步的承认，巴西不再被列入观察名单。”
至此，美国与巴西的知识产权争端暂时告一段落。
二、阿根廷
与巴西一样，美国与阿根廷的知识产权争端，也是早在“特别301条款”制定以前就已发生。而且，也是发生在对药品的专利保护上。
1988年8月10日，“制药协会”提出申请，诉称阿根廷拒绝对药品提供产品专利的保护，而且其药品登记的程序是歧视性的。“制药协会”称，阿根廷政府的这些做法是不合理的和歧视性的，对美国商业造成了负担或限制。1988年9月25日，美国贸易代表就阿根廷的某些做法发起调查，并征求公众意见，以便与阿根廷政府磋商。1988年12月和1989年8月，美国与阿根廷在布宜诺斯艾利斯举行了两轮磋商。在磋商中，阿根廷表示愿意修改其药品登记程序，并建设性地解决对药品提供产品专利保护问题。基于阿根廷的上述承诺，“制药协会”于1989年9月23日撤回了申请。随后，阿根廷采取措施简化和修改了药品登记程序，使之增加了透明度。此外，针对美国所关注的问题，阿根廷政府还于1991年10月10日提出了一个广泛的对现行专利法（颁布于1864年）进行修订的法案。
事实上，在美国贸易代表应“制药协会”的请求对阿根廷发起“301条款”的调查后不久，美国国会就制定了“特别301条款”。在1989年至1992年的“特别301条款”年度审查报告中，美国贸易代表连续四次将阿根廷列入“观察名单”。此时，美国贸易代表似乎不认为阿根廷在知识产权保护方面存在着严重问题。
