十二世界
十二国的世界，是依照山海经中神仙和妖魔存在的世界改编。其文化与政治制度和古代中国，特别是周朝十分类似。存有专制王朝，但王位不可世袭，由每国的神兽麒麟依从天意选择。每个国家均有九州，各州侯由王分封。王和一些高官均可向天帝上奏成为神仙，除非被冬器（冬官府制作的、特殊的带符咒的武器。能斩杀妖魔和仙。）斩首或身体被截成两段外，基本上是长生不老的。若王不依从天意治国，悖离仁道，麒麟就会染上失道之症，除非王可以改过自身、自杀或向天帝请求退位外，麒麟会染病至死。麒麟死后王也会随之在一年之内死亡。
与其他奇幻小说的世界设定不同，十二国的世界中除非得到他国的国王或朝廷(若王不在位时)的同意，不得干涉他国内政，或向他国出兵(不论任何理由)。否则该国国王触犯了觌面之罪，王和麒麟会死亡，而且国氏会改变(重大罪行)。
地理设定
在这个异世界，包含了十二个国家：
四大国
庆（庆东国）、奏（奏南国）、范（范西国）、柳（柳北国）
四州国
雁（雁州国）、巧（巧州国）、才（才州国）、恭（恭州国）
四极国
戴（戴极国）、舜（舜极国）、涟（涟极国）、芳（芳极国）
包围着这十二个国家的，是无尽的虚海。而在这个世界的中央，是“第十三个国家”——黄海。黄海是一片荒芜的大陆，这是一块堪与一国匹敌的广大土地，虽说是海，但却没有水。那里所流动着的只有时间和风，除此之外就是无边无际的沙漠和树海。这是一块被沼泽地和绵延的岩山环绕的土地。
被青海、赤海、白海和黑海所环绕。黃海是由金刚山所环绕之陆地，不属于凡人的世界。黃海当中有五座山，其中最重要的可算是蓬山，仙女们都居住在蓬山上的「蓬庐宫」，由玉叶仙子管理，当蓬山的舍身木长出卵果生出了麒麟后，麒麟就为当时的蓬山公（对蓬山之主麒麟的尊称。在麒麟住在蓬山的期间），居于蓬庐宫內由女仙们细心照料，直到选出王后，麒麟会下山跟随王至所属国家的王宫居住。
在这黄海的中心高耸着一座绵延的山脉。它由五座高山组成，被称为五山。中央的高山是崇高山，其四周环绕的高山分别叫做蓬山、华山、霍山和恒山。蓬山旧称泰山，因其不祥而改名为蓬山。蓬山之名至今已经沿用千年左右。据说五山是西王母的山，蓬山的主人是王夫人，上有舍身木，有蓬庐宫、甫渡宫，是麒麟诞生和成长的地方，也是人与神唯一会发生交集的地方。
十二國的生物動植物都是從特定樹種所結出的奇異果實出生，而這些可以生出各式生物的果實便稱為「卵果」，動物會結出幼崽，植物會結出種子。
里木：里木所产出的“卵果”。如果一对夫妇想要个孩子，那么他们就会来到供奉里木的祠堂，向里木贡献供品并许愿，然后将带子缠绕在里木上。缠绕着带子的里木树枝会结出卵果。卵果需要过10个月才能成熟，届时就可以在卵果旁边等候一个晚上，第二天将卵果切开，就会得到想要的孩子（不是父母无法摘下卵果。）。如果想要家畜或其他动物植物都是通过同样的方式，通过里木的果实得到。得到的也许是人，也可能是半兽（一半為人，一半為獸。可化身為人或獸的姿態）。
舍身木：蓬山上麒麟出生之木。
野木：從郊外的「野木」所結出的卵果所出生的是野獸，至於妖魔聽說也是從卵果裡出生，但卻不知結出其卵果的樹木為何或者在哪裡。奇特的是妖魔從來不會接近里木或野木，原因不明。山野之中兽和鸟、草和木的种果。也有生活在水中的鱼的木。黄海上找不到，一般认为黄海上没有野木。野木之下不会受到妖魔和野兽的袭击。
路木：王宮中有一木，稱為路木，是整個國家里木的來源，枝條杆插可以形成新的里木，王的孩子和新的農作物都在此木祈求，只有王能親自祈求，如果求到新作物的卵果，次年全國的里木都會結出新作物的卵果。
文中对植物没有着墨很多，而动物则大致可分为：
神兽：在十二国中拥有特殊使命和用途的动物，例如麒麟。
麒麟：麒麟虽然是最强神兽，但却有极其强的惧血症（就算自己的血也一样），见到血就会四肢无力甚至晕厥（严重的话，会影响女怪与使令导致它们只能躲在麒麟的影子里不能出来，从而不能保护麒麟），这也是它们作为仁兽的本性，它们是不会伤害任何一个生命的。但为了保护麒麟和王，就不可避免的要杀死一些危害王和麒麟生命的敌人，这就需要麒麟借助外力来帮忙，于是就有了作为使令的妖魔。
转变：麒麟从人形变成兽形。
转化：麒麟从兽形变成人形。
使令是妖魔之中相当重要的一种角色。
麒麟和妖魔通过契约结成主仆关系，成为使令的妖魔完全服从于麒麟和王，听从他们的命令，自觉保护他们的安全，但从此不会主动攻击人类，因为这样违背麒麟的本性，他们平时都躲藏于麒麟或王的身旁，人们不会看到他们，只有在有需要的时候它才会出现。
女怪：一旦麒麟的卵果開始結果，與麒麟卵果相對位置的捨身木根部便同時會有「女怪」誕生，麒麟幼時為奶媽，成年後擔任使令，麒麟生命結束之時死去，一生只為保護這一匹麒麟而生的妖獸。
妖魔：一般出没于黄海。但当王“失道”而倾颓时，会在国家内袭击人类的飞禽走兽。被麒麟使用降妖的本领及麒麟自身的实力降服后，就和麒麟缔结契约，成为“使令”，只听从麒麟或王的吩咐。
妖魔和麒麟订立契约，契约从此就会束缚妖魔的行为。妖魔是在天纲（天纲又称太纲、施予纲天帝发布的统治世界的规定。必须严格遵守。）以外（被天帝抛弃）生存着的东西，为了使它回到正道之中，不让它再沦入邪运，这就是束缚。能够接受的妖魔，就会成为使令。麒麟是靠力量来使妖魔折伏的。为了要将妖魔自暗中投入光明。就必须要具备与其相符合的力量。妖魔会通过这股力量，来决定是不是值得这么做，（如果该麒麟没有降服妖魔的实力，会被吃掉的，虽然说麒麟是跑得最快的生物）。同样的，妖魔会在麒麟死后，获得麒麟的尸体，它们将吃麒麟的尸体，以获得新的力量。这就是妖魔与麒麟间的契约。
所以，虽说麒麟在死后名义上是和王合葬，但是麒麟的棺木里却是空的。
妖兽：一般出没于黄海，可被人类驯服作为骑兽。
二声白雉：居住在王宫内的梧桐宫，一生只以人声鸣叫两次。第一声是登基、第二声是驾崩。末声所言就是二声。叫了二声之后白雉即刻死去，其爪子就在次王登极之前暂时充当御玺。
一个国家只要有了王，就会得到麒麟的保佑，国家将风调雨顺，国泰民安。一旦没有国王，妖魔将横行，天灾不断，国家荒废。总之，国王是国家的关键，而国王的命运是和麒麟息息相关。这便是《十二国记》的独特政治与世界观基础。
