我国政府尊重和保护公民的宗教信仰自由和风俗习惯。当今，我国已成立了县级以上伊斯兰教协会420多个，这些地方伊斯兰教协会开展为当地穆斯林服务。现有清真寺35000多座，宗教人士、阿訇、大毛拉有45000多人。
中国伊斯兰教教务指导委员会的成立是当代中国伊斯兰教界的一件大事。
我国现有45000多名伊斯兰宗教人士，进一步提高他们的宗教知识，提高他们的素质和水平是当前的一项主要任务。委员会的重要任务之一，就是组织开展“解经”工作。为了进行正确引导“解经”，教务指导委员会目前已编辑出版了汉文和维文两种文本的《新编卧尔兹演讲集》（一、二、三辑）作为讲经指导范本。范本坚持伊斯兰教的基本精神，宣传介绍了伊斯兰教具有普遍意义的教义、教法观。团结、教育、正确引导穆斯林群众。中国伊协支持各地伊协开办经学院和阿訇进修班的工作；搜集整理伊斯兰教的各类典籍文物，开展伊斯兰教历史、教义的研究。
对广大穆斯林群众的教育关键是教材的编写，中国伊协召开伊斯兰教教材编写委员会会议，专门研究培养伊斯兰教人才的教材如何统一规范等问题。即将组织编写出版《中国穆斯林爱国主义传统教程》《世界伊斯兰教史简明教程》《诵读学简明教程》《阿拉伯文书法简明教程》等四部教材。
我国各民族穆斯林除了接受国内正规学校教育外，还可以通过各类渠道接受宗教教育。例如，通过伊斯兰教经学院的学习，接受比较高层次的教育。我国有许多地方成立了地方性的经文学校。同时，在中国有清真寺教育的形式，也就是经堂教育，每一个清真寺的阿訇、大毛拉、哈提夫可以带满拉或者塔里普。通过这种形式培养宗教人士接班人。目前我国这三种类型的学校每年可培养满拉、塔里普（宗教学生）25000多人。
中国伊协每年组织举行一次颂读《古兰经》比赛和讲瓦尔兹比赛，还把一些在颂读《古兰经》比赛中获奖的优秀选手，派往埃及、伊朗、马来西亚、沙特等国家参加国际比赛，每年还选派30多名留学生在国外知名大学深造。在世界名校艾资哈尔大学、巴基斯坦伊斯兰堡伊斯兰大学、利比亚宣教学院都有我国的留学生。
中国伊协汇编出版了大量的伊斯兰宗教书籍，先后出版了阿拉伯、汉、维吾尔、哈萨克等文字的《古兰经》，同时也印发了阿拉伯文的经典。我国现有出版发行的穆斯林杂志有《中国穆斯林》《宁夏穆斯林》《甘肃穆斯林》《青海穆斯林》《上海穆斯林》《济南穆斯林》《湖南穆斯林》《云南穆斯林》《北京穆斯林》，这些杂志承担着对广大中国穆斯林进行宗教知识的传播和教育。
去麦加圣地朝觐是我国穆斯林重要的活动之一。为此，中国伊斯兰协会为中国穆斯林做了非常细致的考虑，每年组织和帮助有条件的各族穆斯林完成赴圣地麦加朝觐的功课。派出以伊协领导为团长的朝觐工作团，选派随团医生并配备常用药品，增设随团伊玛目，为我国穆斯林提供完善的服务。为了方便居住在全国各地穆斯林朝觐就近启程，减少费用，2007年分别从北京、乌鲁木齐、兰州、昆明等地包机直飞沙特，同时还解决了包机直飞麦地那、提高哈吉的保险理赔金额、改善住宿条件以及延长在麦地那停留时间等问题。
2006～2007年度，中国穆斯林麦加朝觐团于2006年11月29日启程，2007年1月5日至24日回程。我国9600多名穆斯林在中国伊斯兰教协会的组织下乘包机分别从兰州、乌鲁木齐、北京和昆明4地陆续飞赴圣城麦地那。中国国航、东航、南航3家航空公司承担了本年度接送中国朝觐者包机直飞麦地那的业务，前后接送中国穆斯林赴麦加朝觐的包机共31架次。这也是中国穆斯林麦加朝觐史上规模最大的一次。这些近万名朝觐者主要来自宁夏、新疆、青海、甘肃、云南、陕西、内蒙古、河南等8个省区，涉及我国10个信仰伊斯兰教的中国少数民族。通过朝觐活动，我国穆斯林与世界穆斯林相聚在一起，也带去了中国人民对世界穆斯林的友好情意。
中国伊协同世界伊斯兰国家的穆斯林和国际性伊斯兰组织建立了联系，经常参加国际性的伊斯兰学术思想讨论会、纪念会或庆祝活动，并通过友好往来增进中国穆斯林同各国穆斯林的友谊和相互了解，声援和支持阿拉伯各国人民和巴勒斯坦、阿富汗人民的正义斗争，支持旨在维护世界和平的事业。
