当欧洲人的精神开始苏醒，拉丁基督教本身受到的冲击也很大。这种苏醒让它开始分裂，其中一部分消失，一部分被留下来。而存活下来的部分却被迫改变。
前面我们已经了解，在公元11世纪～12世纪期间，基督国家一直处在拉丁教会的压制下，而进入公元14世纪～15世纪，这种来自教会的力量慢慢消失了。同时，我们也了解了支持教会早期权威的来源，以及教会利用这权威而开始的集权与野心膨胀、弗里德里希与教会之间进行的各种对抗。另外，教会分裂后，教皇权势在政治与民众中开始消亡。而精神苏醒的反抗力量，正由此找到了突破口。
威克里夫[28]的教义，一度被人们广泛传播。1398年，来自捷克的约翰·胡斯特别针对威克理夫教义进行专题演讲。很快，威克里夫的教义便突破学者阶层的认知，在普通民众中得到快速传播。1414～1418年，基督教的所有拉丁教会在康斯坦茨举行会议，就内部分裂的问题进行讨论。约翰·胡斯也受到了邀请，他在得到皇帝承诺的生命安全之后，亲自参加。不过，这种保证并没什么用，他最终还是被抓了起来，并被教会定义为异端邪说，然后于1415年用火刑烧死。教会这样的做法并没把人们压制下去，相反，这让约翰·胡斯的追随者展开一场针对拉丁教会的起义，这使得教会最终分裂。为了平复起义事件，康斯坦茨会议推举马丁五世为教皇，重新光复基督拉丁教会，他下令启用十字军，对约翰·胡斯的教派进行攻击。
不过，马丁五世对这个教派先后5次进行攻击，但没有一次成功。15世纪，一批无业人员组成的十字军蜂拥至波西米亚，对约翰·胡斯的教派进行征讨，就如同在公元13世纪对华尔多教派的征讨一样。但这并没有让约翰·胡斯教派害怕，反而是前来征讨的十字军，当远远听到该教派沉重的战车声响和嘹亮的战歌时，已经吓得完全不能前进，而这时，战争还没有开始。不得已，拉丁教会于1436年在巴塞尔召开了一次宗教会议，并与胡斯的教派签订其合法协议。至此，多种宗教仪式被拉丁教会接受。
进入15世纪，欧洲暴发瘟疫，这让社会产生很大动荡。百姓的生活因此贫困不堪，法国、英国民众因此展开针对贵族的起义。其实，在胡斯教派举行起义之后，德国农民已经多次进行起义，而且规模也一次比一次大，其中还带有浓重的宗教意味。另外，印刷术得到传播之后，也深刻地影响到了农民起义。当时是15世纪中期，印刷术已经传到了英国、意大利。卡克斯顿于1477年在英国建立印刷书籍厂，专门对《圣经》以及一些宗教书籍进行印刷。结果，《圣经》成了街头巷尾被广泛传播的书籍，几乎人人都可以阅读。欧洲民众对《圣经》的了解程度，是过去从没有过的。当教会因为分裂而自身不保时，当王室成员为减弱教会聚敛财富而斗争时，人们的大脑中，关于教义中自由、尊严的新思想便被快速灌输进去。
1517年的德国，马丁·路德修道士组织了一场反对教会的起义。他在教堂门前贴出一张《关于赎罪券效能的辩论》，用它来抗议教派的教义与仪式。开始，他用拉丁语写辩论，后来，他通过印刷的方式来传播，于是，德文版的《关于赎罪券效能的辩论》以及他的个人意见被百姓们所了解。这时，就像当年胡斯遭到压迫一样，有人开始策划对马丁·路德的暗害。不过，因为印刷术，马丁·路德的名字已经被当时德国王室中的很多人熟知，并成为他的支持者，这让他避免了受到迫害的危险。
在这种自由思想开始不断膨胀，但教会权力慢慢减弱的时期，统治者会为了保证自己的利益，而与罗马、罗马教会切断宗教关系。他们希望，自己国家的宗教可以受国家领导。于是，英国、瑞典、苏格兰、德国、波希米亚等很多国家都先后与罗马教会断绝关系，自此他们一直独立存在。
不过，统治者对于百姓的自由、道德似乎并不关心。开始时，他们利用百姓的力量，与教会抗衡，但当他们成功脱离教会，并建立了受自己控制的国家教会之后，他们就开始想要掌控百姓以及人们的起义活动了。但是，耶稣教义中的关于正义、尊严的力量，已经超过了人们对忠诚、世俗以及服从的力量。这些企图想要像拉丁教会一样掌控、压迫百姓的国家教会，无不再次面临分裂，并变成百姓与上帝之间单纯的，没有王室干预的小教派。比如苏格兰、英国这样的国家，就有很多人以《圣经》为信仰，但却绝不服从国家教会的规则。英格兰将这样的人视为“不奉国教者”，正是这些人，曾在公元17世纪～18世纪，于国家政治中产生深刻影响。而英国，这样的群体也一度存在，并持续11年之久。
那些最终与拉丁基督教脱离了关系的北欧国家，其脱离过程便是我们所说的宗教变革。这种变革的力量，让拉丁教会自身受到严重影响。它们不得不重新进行组合，并为其注入全新的教义精神。在这种新变化的过程中，伊尼戈·洛佩斯·雷·卡尔德的名字不得不提，他是一名西班牙的年轻士兵，人们都叫他伊格内修斯·罗耀拉。这是因为，他年轻时作为士兵，经历了一些比较传奇的事情，又于1538年成为一名牧师，从而建立了耶稣会。伊格内修斯·罗耀拉将自己在军队受到的正义、大方的教导，直接融入宗教中去。教派成立之后，很快就成为规模最大的组织之一。他们将这一教派向中国、印度、美国等国家进行传播，这种做法让罗马教会不至于快速消亡。同时，他们将天主教的水平进行提高，不论智力还是良知都进行了开发。这一宗教的成立，让欧洲兴起的各个新教派都产生竞争的压力，从而努力改革。现在，我们所了解的这个富有进取心又充满活力的罗马天主教，其本质就是当时耶稣会的复兴产物。
